Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC27P30260 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC27P30260 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC27P30260 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC27P30260 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC27P30260 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC27P30260 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC27P30260 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC27P30260 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC27P30260 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC27P30260 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC27P30260 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC27P30260 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC27P30260 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms