Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GCAP28676 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCAP28676 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCAP28676 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCAP28676 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCAP28676 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCAP28676 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCAP28676 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCAP28676 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCAP28676 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCAP28676 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCAP28676 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCAP28676 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCAP28676 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCAP28676 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCAP28676 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms