Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms