Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX2P28328 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX2P28328 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX2P28328 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX2P28328 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX2P28328 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms