Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO2P25791 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO2P25791 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO2P25791 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO2P25791 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO2P25791 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms