Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2AP24928 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms