Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms