Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2P22307 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2P22307 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2P22307 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2P22307 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2P22307 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms