Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COL9A1P20849 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A1P20849 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms