Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms