Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms