Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB1P19838 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB1P19838 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB1P19838 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB1P19838 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB1P19838 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB1P19838 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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