Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC3P19447 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms