Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms