Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDCP19113 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDCP19113 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDCP19113 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDCP19113 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDCP19113 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDCP19113 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDCP19113 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDCP19113 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDCP19113 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDCP19113 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDCP19113 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDCP19113 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDCP19113 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDCP19113 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDCP19113 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms