Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT15P19012 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT15P19012 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT15P19012 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT15P19012 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms