Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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