Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF4P18085 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF4P18085 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF4P18085 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF4P18085 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF4P18085 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARF4P18085 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms