Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GM2AP17900 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GM2AP17900 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GM2AP17900 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GM2AP17900 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GM2AP17900 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GM2AP17900 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GM2AP17900 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GM2AP17900 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GM2AP17900 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GM2AP17900 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GM2AP17900 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GM2AP17900 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GM2AP17900 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms