Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAP43P17677 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAP43P17677 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAP43P17677 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAP43P17677 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms