Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7P17544 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7P17544 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATF7P17544 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7P17544 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7P17544 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7P17544 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7P17544 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7P17544 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7P17544 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7P17544 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7P17544 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms