Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms