Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSP16219 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSP16219 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSP16219 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSP16219 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSP16219 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSP16219 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSP16219 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSP16219 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSP16219 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSP16219 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms