Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRG2P13727 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRG2P13727 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRG2P13727 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRG2P13727 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG2P13727 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG2P13727 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG2P13727 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG2P13727 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG2P13727 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG2P13727 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG2P13727 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG2P13727 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG2P13727 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms