Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFTRP13569 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFTRP13569 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFTRP13569 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFTRP13569 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CFTRP13569 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFTRP13569 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFTRP13569 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFTRP13569 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFTRP13569 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFTRP13569 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFTRP13569 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CFTRP13569 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFTRP13569 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFTRP13569 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFTRP13569 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CFTRP13569 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFTRP13569 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CFTRP13569 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFTRP13569 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFTRP13569 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFTRP13569 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFTRP13569 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFTRP13569 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFTRP13569 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFTRP13569 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CFTRP13569 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CFTRP13569 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CFTRP13569 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CFTRP13569 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFTRP13569 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFTRP13569 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFTRP13569 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFTRP13569 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFTRP13569 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFTRP13569 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFTRP13569 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFTRP13569 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFTRP13569 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFTRP13569 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFTRP13569 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFTRP13569 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFTRP13569 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFTRP13569 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFTRP13569 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFTRP13569 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CFTRP13569 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFTRP13569 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFTRP13569 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFTRP13569 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFTRP13569 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFTRP13569 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFTRP13569 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFTRP13569 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFTRP13569 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CFTRP13569 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CFTRP13569 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CFTRP13569 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CFTRP13569 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CFTRP13569 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFTRP13569 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFTRP13569 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFTRP13569 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
CFTRP13569 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms