Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BMP3P12645 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BMP3P12645 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BMP3P12645 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP3P12645 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP3P12645 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP3P12645 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP3P12645 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP3P12645 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms