Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARAP10276 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARAP10276 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARAP10276 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARAP10276 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARAP10276 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARAP10276 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARAP10276 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARAP10276 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARAP10276 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARAP10276 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARAP10276 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARAP10276 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARAP10276 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RARAP10276 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARAP10276 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms