Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RD3LP0DJH9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms