Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms