Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD1P0DJD0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms