Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms