Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms