Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIL1P09327 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIL1P09327 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIL1P09327 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIL1P09327 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIL1P09327 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIL1P09327 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIL1P09327 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIL1P09327 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIL1P09327 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIL1P09327 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIL1P09327 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIL1P09327 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIL1P09327 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIL1P09327 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIL1P09327 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIL1P09327 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VIL1P09327 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VIL1P09327 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VIL1P09327 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VIL1P09327 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIL1P09327 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIL1P09327 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIL1P09327 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms