Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP3P08254 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP3P08254 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP3P08254 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP3P08254 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP3P08254 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP3P08254 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP3P08254 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP3P08254 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP3P08254 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP3P08254 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP3P08254 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP3P08254 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms