Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8AP07357 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8AP07357 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8AP07357 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8AP07357 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8AP07357 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C8AP07357 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8AP07357 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8AP07357 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8AP07357 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8AP07357 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8AP07357 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms