Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCGP05129 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCGP05129 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms