Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms