Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOEP02649 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOEP02649 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOEP02649 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOEP02649 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOEP02649 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOEP02649 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOEP02649 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOEP02649 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOEP02649 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOEP02649 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOEP02649 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOEP02649 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOEP02649 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOEP02649 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOEP02649 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOEP02649 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268 ms