Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD4P01730 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD4P01730 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD4P01730 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD4P01730 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD4P01730 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD4P01730 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms