Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFNA21P01568 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA21P01568 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms