Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F9P00740 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P00740 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P00740 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P00740 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P00740 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms