Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EGFRP00533 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EGFRP00533 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFRP00533 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFRP00533 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFRP00533 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFRP00533 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFRP00533 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFRP00533 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFRP00533 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFRP00533 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFRP00533 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFRP00533 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFRP00533 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFRP00533 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFRP00533 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EGFRP00533 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EGFRP00533 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFRP00533 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms