Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TSPAN13O95857 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TSPAN13O95857 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TSPAN13O95857 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TSPAN13O95857 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TSPAN13O95857 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TSPAN13O95857 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TSPAN13O95857 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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