Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms