Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLDN7O95471 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms