Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG2O94898 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG2O94898 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms