Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEBLO76041 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEBLO76041 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEBLO76041 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEBLO76041 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEBLO76041 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEBLO76041 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEBLO76041 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEBLO76041 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEBLO76041 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEBLO76041 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEBLO76041 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEBLO76041 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEBLO76041 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEBLO76041 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEBLO76041 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEBLO76041 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEBLO76041 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms