Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPM3O75607 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPM3O75607 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPM3O75607 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPM3O75607 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPM3O75607 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPM3O75607 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPM3O75607 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NPM3O75607 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPM3O75607 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NPM3O75607 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPM3O75607 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPM3O75607 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPM3O75607 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPM3O75607 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPM3O75607 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPM3O75607 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPM3O75607 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms