Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH16O75309 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH16O75309 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms