Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN2BO60939 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms